内陆盆地以北的丘陵和山脉之间的山谷通常为东西向，这些山脉南坡陡峭，北坡的山势则很平缓，每个山峰到山下河道的坡度都很小。丘陵和山谷完全被茂密的热带森林覆盖。这是一个名副其实的丛林，其中有桃花心木、人心果树、橡胶树、曼密苹果树、雪松、木棉或亚克谢、野生无花果树、面包果树、牛油果树、多香果树、羽叶棕榈、扫帚棕榈以及其他许多不知名的植物，而且这些树木在北方气候区根本找不到。
其中，人心果树可出产像牛奶一样的汁液可以制成口香糖，玛雅人很早就开始咀嚼这种树脂来提神洁齿，还可运用在治疗痢疾和疟疾上。树干通常用作玛雅神庙里的房梁。其果实用于胃脘痛，树皮用于急性肠胃炎、扁桃腺炎，种子有利尿的作用。人心果的果实提取物还有抗氧化、皮肤保湿、促进肌肤血液循环和毛发生长等作用，后来被广泛用于润肤乳、护发液等产品中，有很高的经济价值。人心果的果实可当做蔬菜食用，味甜可口，除了可作水果鲜食外，也可制成果汁、果脯、果酱等。
美洲曼密苹果树的果实可以食用，成熟的果实富含果胶，可用于制作果冻、果酱和蜜饯。此外，果实还可以用于酿酒。树的各个部分，包括种子、茎、叶、根和未成熟果实的提取物，具有杀虫活性，可用于制作杀虫剂。特别是，果实的提取物还具有抗菌和抗肿瘤活性。在某些地区，美洲曼密苹果被用于美容，例如软化头发和制作面膜，具有软化和保湿的效果。
亚克谢是玛雅人的圣树，被称为“生命之树”，是一种能生产棉花的木棉树。同时也是一种坚韧的树种，可以长到70米左右，木棉树的木材具有高密度和良好的韧性，能够承受海上的风浪和撞击。此外，木棉树的木材还具有较好的防水性能，能够在潮湿的环境中保持船体的完整性。这些特性使得木棉树成为造船的重要材料之一。
野生无花果树是玛雅人用来制成纸的，面包果树既可以用来食用又可以在干旱时用来蓄水，叶子可以用来作为饲料，和非洲的猴面包树有类似功能。