秦王准备御驾亲征进攻西安城的消息传到了李自成耳中，李自成也慌乱了起来，知道秦国是来真的，于是连连催促手下加快速度准备撤退。
在秦王李恒出征前，钟子清进宫提醒秦王绝对不能让李自成活下去，否则的话天下将永无宁日。
李恒明白了钟子清的意思，于是秘密派人前往在夔州府的第三镇总兵程猛，让他派兵进入湖广郧阳府，在李自成带兵经过的时候设伏干掉李自成。
因为有牛金星这个内应，所以李自成撤离的时间路线秦国这边一清二楚。
半个月后，李自成带着数万人马以及家眷等人撤出了西安城，从潼关方向进入了河南。然后打算从河南进入湖广。
这显然是忌惮秦军，所以不敢从最近的商州方向进入湖广。
李自成在进入河南之后，驻守潼关的刘宗敏也带兵撤出了潼关，跟着李自成一起向南进入了湖广郧阳府。
秦王李恒收到了李自成撤走的消息后大喜，立刻下令秦军尽快占领西安城。
很快，西安城完好无损地落入了秦军手中，随即李恒又派李定国带领秦军第八镇占领潼关，同时又让马科率领秦军第七镇北上接管延安府。
延安府的大顺军因为路途遥远，来不及跟李自成一起撤离，所以在马科带兵抵达之后，很多人还不知道发生了什么。
马科告诉了他们说李自成已经撤出西安城逃亡湖广的消息，众人惊慌不已。
一部分人选择了离开，前往湖广追随李自成。还有一部分选择了投降秦军。
因为李自成的主动撤离，残存在陕西各地的大顺军群龙无首，许多人被迫归顺了秦军。
短短一个多月的时间，陕西大多数地方相继落入了秦军手中。
明朝时候的陕西，包括后世的陕西和甘肃大部分地区，其下辖八府两州，分别是：西安府、凤翔府、汉中府、延安府、庆阳府、平凉府、巩昌府、临洮府和灵州、兴安州。
西安府，延安府，汉中府，兴安州已经全部落入了秦军手中，秦王李恒又派手下大将李成等人带兵继续向西和西北进军，相继占领庆阳府，平凉府，凤翔府，临洮府等地，这些地方的大顺军要么望风而逃，要么不战而降，秦军进展的非常顺利。
不过也有不少忠于大顺国，忠于李自成的将领带着残兵想方设法绕过秦军防线前往湖广寻找李自成。
秦军对于这些人也是睁一只眼闭一只眼，给他们开方便之门。
让这些人进入河南和湖广境内，对于将来秦军占领这些地区大有好处。
且说李自成带兵从河南进入湖广之后，途径武当山的时候，李自成心血来潮想要上山祭拜。结果在下山的时候遇到了一群不知道从哪里杀出来的明军的围攻。
当时李自成身边只有数百名士兵，而明军却有千人之多，且装备精良，战斗力极为强悍，李自成身边的卫兵很快伤亡殆尽，李自成本人也死在了乱军之中。
李自成一死，他带来的数万大顺军很快陷入了内讧之中。刘宗敏主张继续向襄阳进发，占领襄阳，再续大顺国祚。
而郝摇旗等将领却说要找到那支杀害李自成的明军，剿灭他们给李自成报仇。
而牛金星却提出李自成已死，大顺国已经大势已去，无力回天，不如归顺秦国。
三派争执不下，甚至差点发生武装冲突，最终导致了数万大顺军分崩离析，刘宗敏带着一万余人继续向襄阳赶去，郝摇旗等人却就地安营扎寨，派人寻找那支袭击李自成的明军想要报仇雪恨。
而牛金星则带着一部分亲信向西进入了四川夔州府境内，想要前去成都投奔秦王李恒。
没想到还没进入夔州府，就遭到了郝摇旗等人的突袭，牛金星在乱战之中不慎跌入山崖下摔死，其亲信部下等人也死伤惨重。
原来是有人投信给郝摇旗，说李自成之死是因为牛金星勾结明军导致的。
郝摇旗本来就对撤出西安城不同意，对于牛金星也早就看不惯，看到那封匿名信之后更是想起种种不对劲的地方，心头怒火越烧越旺，于是生出了带兵杀掉牛金星为李自成和李岩报仇的心思，这才有了前面一幕。
经过这次之后，大顺军内部更是四分五裂。郝摇旗继续带兵向南打算进入云南恢复元气。
那支袭击李自成的“明军”自然是秦军假扮的。秦军第三镇总兵程猛在收到秦王李恒的密旨后亲自带兵进入了郧阳府，换上明军的衣袍装束潜伏了下来，同时派人打探李自成等人的踪迹。
在得知了李自成进入了郧阳府境内并向着武当山方向而来时，程猛推测李自成很有可能会前往道教名山武当山来参拜真武大帝，所以带兵埋伏在武当山脚下。
李自成果然如程猛猜测一样上武当山参拜真武大帝，于是就有了前文下山被伏击一事，因此葬送了性命。
一代英雄就此殒命。
给郝摇旗投信这件事也是程猛派人做的，目的自然是趁机干掉牛金星这种无德的投机小人，同时进一步加深大顺军之间的裂痕，让他们再也无法拧成一股绳。
李自成被杀，牛金星身死，大顺军四分五裂的消息传到秦王李恒耳中之后，李恒长舒一口气，给程猛和第三镇下了一道嘉奖诏书。
至此，曾经纵横北方，一度风头无量的大顺军就此落幕。
秦国在北方的主要敌人变成了刚刚入关的满清。
而兵分两路想要在西安合围李自成的满清这边，多铎在收到了探子汇报，说是潼关的大顺军已经撤离，大喜之下正要派兵抢占潼关的时候，却又收到消息，潼关已经被秦军给占领。
多铎又惊又怒，惊的是刚刚立国的秦军动作竟然如此之快。
怒的是秦军竟然敢在虎口拔牙，于是立刻带兵气势汹汹地赶往潼关，准备一举夺回潼关。
而另一路的阿济格也终于从草原上南下进入了延安府境内，来到了长城附近的衡山城下。