（吏部设）通政司、廉政司、布政司。
（户部设）户籍公馆、移民公馆、农业公馆、住房公馆、财政公馆、地税公馆、国税公馆。
（礼部设）法典司、使节公馆、教育公馆。
（兵部设）海军都督府、陆军都督府、空军都督府、禁卫军都督府、海关公馆。
（刑部设）刑律司、典律司、国家安全局、巡捕公馆。
（工部设）医疗公馆、建设公馆、交管公馆、工商公馆、旅游公馆、特别金矿局、后勤保障司。
（公馆衙门长官为理事，都督府衙门长官为都督，司衙门为使，局衙门为长。长官均为正三品官职。）
公馆、局下属地方衙门为公所、分局，受地方府县衙门监管，对上级直接负责，地方府县主管官员拥有推荐任命、上奏罢免其监管衙门长官的权利。
总体来说，地方府县长官的权利得到了提升。