于是兜兜转转，威尼斯元老院最终给政府施加压力，授权使节跟罗马人进行谈判。
于是就有了二次谈判破裂后，发生在6月上旬上午的这一幕——
君士坦丁堡大皇宫内，曼努埃尔的老熟人，从博斯普鲁斯时期就已经跟他打交道而得到威尼斯当局全权授予的贝尼托·格拉西奥对着巴西琉斯控诉道：“曼努埃尔陛下，我代表威尼斯十人团及元老院的意志奉劝您停止对我国土地不公正的侵占。”
“朕指正一下，这些都是罗马人的土地。”手持权杖身披达尔马提卡礼服的曼努埃尔作出了“温馨提示”，“即使它们被拉丁人侵占了两百年，也不代表着它们成为了异族的属地。更何况朕这么做是在拯救这些殖民地上的罗马人，难道您想说威尼斯把他们都当成自己的子民吗？朕没记错的话，拉丁人治下的罗马人地位甚至可以跟非洲来的奴隶相比呢。”
“我们公教世界曾经在你们危难之际提供无私的援助，你们怎能如此背信弃义？如此行径是得不到主的宽恕的！”
“罗马的宗座都没意见，这样吧，你们要不从你们的教宗那里要一份特许状，把我们罗马人都打成信仰撒旦的路西法信徒，然后号召再一次第四次十字军东征，扶持一个软弱无力的拉丁帝国，再抢占一次罗马人的海岛怎么样？”说罢，朝堂之上立即传来了明显的讥笑声，威尼斯的使者们更加汗颜。
但巴西琉斯并没有停止他的攻势，“还有威尼斯人怎么就能代表整个公教世界了来对着当年圣战的主力军大放厥词了？你们是想朕要把你们曾经在当年圣战中的骑墙行为公之于众吗？以及呢，要拉罗马宗座的大旗，最好先把冕下的拉文纳还回去吧。”说到这，朝堂上又传来了一阵对威尼斯的哄笑。
“哦，曼努埃尔陛下，您怎么这样？”格拉西奥一脸痛心地斥责他，“您难道忘记了过去那些年我们两国精诚合作度过的欢乐时光了吗？”
“够了格拉西奥阁下，你们威尼斯输不起就投降吧。以前是以前，现在是现在，您要是一直拿以前当现在，怎么不从出生的时候说起啊。”曼努埃尔起身，清了清喉咙，一本正经地继续说道，“而且你们拉丁人要明确明白的是，朕可是全体罗马人民的皇帝，朕的所作所为都是为罗马人负责。”谈判破裂后他扯什么宗教上的大义也没用，更重要的是直接怼得对方气势落入下风。
“陛下您最好真的是……”
“朕给过你们机会了，”曼努埃尔无视他的嘀咕，冷冷说道，“本来罗马人交钱，你们交出特权与一部分土地，皆大欢喜。现在闹得双方都不愉快，这不是你们自找的吗？
“另外，想耗就耗吧。”他冷冷说道，“朕有得是时间和精力跟你们耗！”
就这样，这场早已谈崩的谈判彻底闹崩，战争继续。
1455年8月，罗马海军终于拔掉威尼斯在纳克索斯群岛的最后据点阿波罗尼亚（Πολλώνια）岛，将整片西爱琴海群岛重新收归于帝国治下。
往后两年半，两国开启了无限制海战，双方在东地中海毫无节制地击沉对方的战船商船，互相劫掠敌方的海岸线，俘杀其军民。起初，由于帝国海军实力逊于威尼斯人，所以罗马人的损失最初较大。但在帝国庞大的国力支撑下，威尼斯人逐渐落入下风。毕竟帝国除了海上贸易之外，还能通过收取各项税金与开展陆上贸易牟利，完全依赖海贸的反而是威尼斯人。
这场对双方沿海都颇为惨烈的战争持续到了1458年年初时，实在耗不起的威尼斯共和国在闻知罗马教廷、热那亚共和国与奥地利大公国将在帝国鼓动下背刺自己的传言后选择投降。
此役之后，帝国收复了之前威尼斯占据的除科孚岛与克里特岛外的所有爱琴海沿岸岛屿，而战败的锅也被威尼斯十人团甩给了现任总督弗朗切斯科·福斯卡里。这位年老的总督曾经一手主持并推动了跟加夫拉斯家族的所有合作与较量，这曾给他带来诸多利益与荣耀，但也正因此在这年被弹劾下台。最终，85岁的他拖着苍老的身体离开了自己的祖国，默默地在之后不久病死在了某个意大利城邦中。
战后，曼努埃尔并没有急着兑现跟热那亚人的承诺。一直拖到1458年年中，热那亚共和国被法兰西国王查理七世率军占领，他才当机立断，趁人之危赖掉了对热那亚的所有承诺。同年，他通过笼络统治热那亚爱琴海殖民地的加蒂卢西奥等贵族，收复了希俄斯等岛屿。至于拉丁人的商贸特权，也在此期间彻底被收回。
自此，除科孚与克里特以外的爱琴海诸岛重归于罗马帝国治下，系在帝国脖颈上的拉丁绞索被彻底撕碎。