木叶孤儿院的历史可以追溯到第二次忍界大战期间，在战争中，许多孩子失去了亲人，成为了孤儿。
为了集中照顾这些孤儿，木叶忍村建立了木叶孤儿院。
木叶孤儿院不仅为孤儿们提供了生活的场所，还为他们提供了教育和训练。
在木叶孤儿院中，孤儿们可以学习忍术、文化知识和生存技能，为将来成为一名优秀的忍者做好准备。
木叶孤儿院的前任院长是药师野乃宇，她是一位非常善良和有爱心的人，深受孤儿们的喜爱和尊敬。
此外，木叶孤儿院还有一些老师和工作人员，他们也为孤儿们的成长和发展做出了贡献。
不过很可惜的是，孤儿院最终还是被志村团藏盯上。
孤儿院院长药师野乃宇曾是根部的成员，因无法做到冷酷无情而选择退出，只是志村团藏又怎么会如她的心意。
志村团藏为了继续控制药师野乃宇，便以孤儿院的经费做为要挟，让对方为自己执行间谍任务。
在此期间，志村团藏更是吸收了一批孤儿进入到根部之中，其中就有药师兜。
在一次任务中，团藏为了获取药师兜和药师野乃宇身上的情报，便安排他们自相残杀。
药师野乃宇在临死前也没有认出杀死她的人是药师兜，这一事件对药师兜产生了深远的影响，使得他陷入了黑暗和迷茫之中。
自从误杀了视之为母亲的药师野乃宇后，药师兜便对志村团藏和木叶产生了极大的仇恨。
为了达到帮助自己复仇的目的，使得药师兜甘愿成为大蛇丸的助手和眼线，为后来的木叶崩溃计划提供情报支持。
木叶孤儿院的位置比较偏僻，位于村子的西北角，这附近并没有其他村民居住。
“请问你找谁？”
当纪云来到孤儿院大门时，被作为门卫的一个中年大叔拦住了，并开始询问他的来由。
“我叫风祭纪云，是应药师兜前辈的邀请，来这里做一天义工的！”
“原来是这样啊，兜确实很不容易，你进去吧！”
中年大叔听到药师兜的名字后，态度直接转变，直接放行让纪云进入孤儿院。
穿过一片小树林之后，纪云便看到一群最小只有2、3岁，最大也不超过10岁的孤儿正在一栋建筑前的草地上嬉戏玩闹着。
而药师兜则是面露微笑的侍立在一旁，时不时的还叫喊着几个比较调皮孩子的名字，让他们不要做出危险的举动。
“兜前辈，我来了！”
纪云直接走到药师兜的身旁道。
“纪云，能麻烦你帮忙照看一下这里吗，我还要去给孩子们准备午餐！”
药师兜见到纪云后，也没有客气，直接让他帮助自己照看眼前的孩子们。
“没问题，交给我吧！”
只是照看这些小孩的话，对于纪云来说十分的简单，便答应了下来。
“呵呵，你可不要小看他们哦！”
在离开前，药师兜说出了一句耐人寻味的话。
“喂，你是忍者吗？”
还没有等纪云回过神来，他就发现自己已经被一群小孩围住了，其中一个缺了颗门牙的小男孩好奇的询问道。
“没错，我现在是一名木叶下忍。”
纪云微笑着回答道。
“那你会很厉害的忍术吗，就是那种喷火或者喷水的很神奇的忍术哦！”
小男孩继续追问道。
“额，我会你说的喷水，不过不怎么厉害！”