林时和小联盟成员们带着沉重的心情继续深入神秘组织的总部。每向前一步，他们心中对这个神秘组织邪恶阴谋的愤怒就增添几分。
他们终于来到了总部的核心区域。这里的建筑风格与之前有所不同，四周都是巨大的玻璃容器，容器内装着各种奇异的生物。有的生物长着巨大的翅膀，身体却像蛇一样扭曲；有的生物则浑身长满眼睛，每一只眼睛都闪烁着诡异的光芒。这些生物似乎都处于沉睡状态，但周围复杂的设备在不断地向它们体内输送着能量。
在核心区域的中央，有一个巨大的控制台。控制台上布满了各种按钮、显示屏和闪烁的指示灯。林时走上前去，试图解读控制台上的信息。
他发现控制台上显示着一些关于全球局势的监控画面。画面中，世界各地的幸存者们在艰难地求生，而神秘组织似乎正在利用源兽和一些隐藏的手段，逐步将幸存者们驱赶到特定的区域。
“看这个。”林时指着其中一个显示屏对成员们说。
显示屏上显示着神秘组织的一个详细计划。他们打算利用基因锁技术，制造一种特殊的信号发射装置。这种装置一旦启动，将会影响所有开启基因锁的人，使他们的思想被控制，成为神秘组织的傀儡。而且，神秘组织还计划将源兽进一步改造，让它们具备更强的攻击性和繁殖能力，然后释放到世界各地，彻底摧毁人类的抵抗力量。
“他们竟然如此狠毒，想要彻底灭绝人类的自由意志。”一名成员愤怒地握紧了拳头。
在控制台的旁边，有一个小型的实验室。林时走进实验室，里面摆放着各种精密的仪器和一些尚未完成的实验样本。他看到一些关于人类基因样本的研究资料，这些资料显示，神秘组织已经找到了一种方法，可以通过修改人类基因中的特定片段，来实现对人类思想的控制。
“他们已经进行到这个地步了，如果我们不阻止他们，后果不堪设想。”林时的表情十分凝重。
继续搜索实验室时，他们发现了一本日记。这本日记是神秘组织内部一名高级研究员的记录。日记中详细记载了神秘组织的起源和他们的终极目标。
原来，这个神秘组织是由一群极端的科学家和野心家组成的。他们认为人类已经无法自我拯救，地球需要一种全新的秩序。于是，他们便开始了这场疯狂的实验，企图通过制造末世、控制源兽和基因锁技术，建立一个由他们统治的新世界。
在日记的最后几页，还提到了一个更为恐怖的计划。神秘组织正在研究一种可以改变地球磁场的装置。一旦这个装置启动，地球的生态环境将被彻底破坏，只有那些经过他们基因改造的生物才能生存下去。