大蛇丸没有让索斯久等，就在一个月之后的某个下午，索斯准备出去摆摊的时候，在街角碰见了堂堂的三忍之一，他带自己去看了他的试验所，那是一个建在地下的实验基地，似乎还很简陋，仪器很少，看样子建成没有多久，大蛇丸说他们可以在这里开发新的忍术，或许以后会成为木叶最先进的研究所也说不定，索斯看着大蛇丸兴奋地样子就知道他现在肯定高兴极了，虽然不知道为什么他就这么信任自己作为禁术开发的合作伙伴，但既来之则安之，现在封印之书在大蛇丸手里，他一定也看了上面的禁术，而且那说不定就是两人接下来的研究方向，所谓风雨同舟，现在有了相同经历的两个人，或许这就是他们能成为合作伙伴的原因所在吧，于是索斯每天又多了一个去处，他晚上仍然是雷打不动的去校门外摆摊，毕竟不管什么人总是要吃饭的，大蛇丸虽然找他一起研究，但是却不会给他发工资，自己的吃饭前还是要靠自己赚，索斯当然要依然操办着旧业来维持生活了。
实验的开端并不顺利，两个人在一开始就产生了一些分歧，大蛇丸似乎对于血继限界很感兴趣，而索斯则觉得一开始就研究这样的项目似乎有点儿太具有挑战性了，而且说到血继限界，那可是各个家族的不传之秘，如果真要研究这个，光明正大的手段是不行的，说不定就要用到一些属于忍者的真正阴暗手段，索斯不反对研究禁术，但是若真的绑架别人过来研究什么的，让索斯还是觉得有点儿无法接受，他倒不是心里头有负担，只是他还想好好地呆在木叶村呢，可不想到最后被人发现，逼得无家可归，成了叛忍，那样颠沛流离的生活他才不想过呢。
索斯是个很重视生活舒适的人，一个稳定安逸的居所对他来说是非常重要的，即使钱不多，只是靠着摆摊卖麻辣烫维持生活，索斯也能在木叶呆这么久就能够看出来了，和大蛇丸不同，索斯当过太长时间的皇帝、国王、首领、他太熟悉这样的角色了，就好像一个人天天都是米饭，早晚有一天会吃腻一样，索斯现在就是对这种领袖的角色感到腻歪了，他没有那么大的野心，他也不想有，他不想去支配任何人，就是想要安安静静地体验一下生活，自从拜托了神明的力量，真的成为一个普通的人，在木叶村生活下来以后，他发现似乎喜欢上了这样的生活，有时候，作为一个相对弱小的存在，反而能给他很多曾经都不曾有过的感悟和启发。
但显然两人不会就这样僵持下来，最后还是在进行了有条件的交换意见后，达成了统一的意见，暂时不会以木叶的几大家族的血继限界为目标，研究的禁术包括二代火影曾经开发过得秽土转生以及两人脑海里逐渐有了些雏形的新咒术。
对于这个结果，无论是大蛇丸还是索斯，都是非常满意了，于是研究所就这样默默地成立了，说是研究所，其实说成是工作室更贴切一点，除了索斯和大蛇丸之外就没有别人了，由于研究的是禁术的原因，索斯自然不会和自来也说，所以他也蒙在鼓里，至于其余的暗部和根的监视，暂且都在大蛇丸的干涉下，保护的很好，两个人的研究有条不紊地进行着。